武漢病毒所在全球蟲媒病毒與節(jié)肢動物特異性病毒序列、多樣性、生物安全風險綜合數(shù)據(jù)集方面獲進展
(資料圖片)
吸血節(jié)肢動物中傳播循環(huán)的病毒有兩大類,即蟲媒病毒(arbovirus)和節(jié)肢動物特異性病毒(arthropod-specific virus,ASV)。蟲媒病毒能在脊椎動物和節(jié)肢動物中復制,對人類或動物具有致病性,給全球公共衛(wèi)生造成負擔。節(jié)肢動物特異性病毒僅在節(jié)肢動物中復制,可能是蟲化病毒進化的起源。然而,目前沒有涵蓋所有已知蟲媒病毒和節(jié)肢動物特異病毒種類、生物安全風險等級、基因組節(jié)段、地理分布等信息的綜合數(shù)據(jù)集。
5月19日,《科學數(shù)據(jù)》(Scientific Data)在線發(fā)表了中國科學院武漢病毒研究所/生物安全大科學中心袁志明/夏菡團隊在蟲媒病毒生態(tài)健康和生物安全領域的最新研究成果(《全球蟲媒病毒和節(jié)肢動物特異病毒的序列、多樣性及生物安全風險綜合數(shù)據(jù)集》,A global dataset of sequence, diversity and biosafety recommendation of arbovirus and arthropod-specific virus)。該研究通過整合美國CDC蟲媒病毒名錄(Arbovirus Catalog)、第六版《微生物和生物醫(yī)學實驗室生物安全》(BMBL 6th)附錄VIII-F、國際病毒分類委員會(ICTV)的病毒分類信息以及Genbank序列等相關信息,提取分類學、生物安全風險、基因節(jié)段、核酸和氨基酸序列、地理分布等信息,構建了首個全球蟲媒病毒和節(jié)肢動物特異病毒的綜合數(shù)據(jù)集。
該數(shù)據(jù)集包含615個蟲媒病毒(460個病毒種)、98,994條記錄和190個節(jié)肢動物特異病毒(180個病毒種)、2,100條記錄,涉及34個病毒科、89個病毒屬和640個病毒種(圖1a)。該成果展示了蟲媒病毒和節(jié)肢動物特異病毒間的基因組節(jié)段差異(圖1b)、生物安全風險建議等級(圖1c)、病毒及其節(jié)肢動物媒介的全球分布、宿主來源等特征(圖1d)。為剖析蟲媒病毒和節(jié)肢動物特異病毒的相互作用、進化規(guī)律和風險評估提供了豐富的數(shù)據(jù)資源(圖2)。
該研究由武漢病毒所和浙江大學合作完成。研究工作得到國家重點研發(fā)計劃、國家自然科學基金和中國科學院中-非聯(lián)合研究中心等的支持。
論文鏈接
數(shù)據(jù)鏈接
圖1. 蟲媒病毒和節(jié)肢動物特異病毒的分類、基因組節(jié)段和生物安全分級建議和宿主來源
圖2. figshare數(shù)據(jù)集部分信息
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