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吸血節(jié)肢動(dòng)物中傳播循環(huán)的病毒有兩大類，即蟲媒病毒（arbovirus）和節(jié)肢動(dòng)物特異性病毒（arthropod-specific virus，ASV）。蟲媒病毒能在脊椎動(dòng)物和節(jié)肢動(dòng)物中復(fù)制，對(duì)人類或動(dòng)物具有致病性，給全球公共衛(wèi)生造成負(fù)擔(dān)。節(jié)肢動(dòng)物特異性病毒僅在節(jié)肢動(dòng)物中復(fù)制，可能是蟲化病毒進(jìn)化的起源。然而，目前沒(méi)有涵蓋所有已知蟲媒病毒和節(jié)肢動(dòng)物特異病毒種類、生物安全風(fēng)險(xiǎn)等級(jí)、基因組節(jié)段、地理分布等信息的綜合數(shù)據(jù)集。

5月19日，《科學(xué)數(shù)據(jù)》（Scientific Data）在線發(fā)表了中國(guó)科學(xué)院武漢病毒研究所/生物安全大科學(xué)中心袁志明/夏菡?qǐng)F(tuán)隊(duì)在蟲媒病毒生態(tài)健康和生物安全領(lǐng)域的最新研究成果（《全球蟲媒病毒和節(jié)肢動(dòng)物特異病毒的序列、多樣性及生物安全風(fēng)險(xiǎn)綜合數(shù)據(jù)集》，A global dataset of sequence, diversity and biosafety recommendation of arbovirus and arthropod-specific virus）。該研究通過(guò)整合美國(guó)CDC蟲媒病毒名錄（Arbovirus Catalog）、第六版《微生物和生物醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室生物安全》（BMBL 6th）附錄VIII-F、國(guó)際病毒分類委員會(huì)（ICTV）的病毒分類信息以及Genbank序列等相關(guān)信息，提取分類學(xué)、生物安全風(fēng)險(xiǎn)、基因節(jié)段、核酸和氨基酸序列、地理分布等信息，構(gòu)建了首個(gè)全球蟲媒病毒和節(jié)肢動(dòng)物特異病毒的綜合數(shù)據(jù)集。

該數(shù)據(jù)集包含615個(gè)蟲媒病毒（460個(gè)病毒種）、98,994條記錄和190個(gè)節(jié)肢動(dòng)物特異病毒（180個(gè)病毒種）、2,100條記錄，涉及34個(gè)病毒科、89個(gè)病毒屬和640個(gè)病毒種（圖1a）。該成果展示了蟲媒病毒和節(jié)肢動(dòng)物特異病毒間的基因組節(jié)段差異（圖1b）、生物安全風(fēng)險(xiǎn)建議等級(jí)（圖1c）、病毒及其節(jié)肢動(dòng)物媒介的全球分布、宿主來(lái)源等特征（圖1d）。為剖析蟲媒病毒和節(jié)肢動(dòng)物特異病毒的相互作用、進(jìn)化規(guī)律和風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估提供了豐富的數(shù)據(jù)資源（圖2）。

該研究由武漢病毒所和浙江大學(xué)合作完成。研究工作得到國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、國(guó)家自然科學(xué)基金和中國(guó)科學(xué)院中-非聯(lián)合研究中心等的支持。

論文鏈接

數(shù)據(jù)鏈接

圖1. 蟲媒病毒和節(jié)肢動(dòng)物特異病毒的分類、基因組節(jié)段和生物安全分級(jí)建議和宿主來(lái)源

圖2. figshare數(shù)據(jù)集部分信息

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