近日，基于全場景AI框架昇思MindSpore開發(fā)的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測模型在全球持續(xù)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測競賽CAMEO（ContinousAutomated Model EvaluatiOn）上連續(xù)三周霸榜，并包攬月榜前二，顯示出昇騰AI基礎(chǔ)軟硬件平臺在AIfor Science領(lǐng)域的強大能力。

4月21日最新月榜競賽結(jié)果

超越AlphaFold2，連續(xù)保持全球第一排名！

由瑞士生物信息研究所和巴塞爾大學(xué)聯(lián)合舉辦的CAMEO（ContinousAutomated Model EvaluatiOn）——全球持續(xù)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測競賽，被認為是蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測領(lǐng)域最重要的比賽之一。

CAMEO競賽的規(guī)則是，每位參賽者需每周對20個由世界范圍內(nèi)的結(jié)構(gòu)生物學(xué)家最新破解出的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)進行預(yù)測，其分數(shù)和名次每周都會進行在線更新。

因此，該競賽吸引來不少世界范圍內(nèi)生物計算領(lǐng)域的前沿模型“選手”?；跁N思MindSporeAI框架訓(xùn)練的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測模型，一經(jīng)亮相，便領(lǐng)跑全球。在最近的三周CAMEO競賽中持續(xù)排名第一，意味著昇騰AI基礎(chǔ)軟硬件平臺在AIfor Science領(lǐng)域的強大能力。

昇思MindSpore蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測模型研發(fā)進展

2021年11月，昇思MindSpore團隊與昌平實驗室、北京大學(xué)生物醫(yī)學(xué)前沿創(chuàng)新中心（BIOPIC）和化學(xué)與分子工程學(xué)院、深圳灣實驗室高毅勤教授課題組聯(lián)合推出基于AlphaFold2算法的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測推理工具，并在2022年2月實現(xiàn)訓(xùn)練的全流程打通，效率同比提升2-3倍。

采用昇騰AI基礎(chǔ)軟硬件平臺后，在混合精度下，單步迭代時間由20秒縮短到12秒，性能提升超過60%。依托昇思MindSpore內(nèi)存復(fù)用能力,訓(xùn)練序列長度由384提升至512。

在訓(xùn)練精度接近AlphaFold2的基礎(chǔ)上，昇思MindSpore在算法、規(guī)模和軟硬件支持等方向上持續(xù)改進，本次發(fā)布的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測模型成績持續(xù)刷新業(yè)界記錄、拿下CAMEO競賽第一，毫無疑問是昇思MindSpore在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測領(lǐng)域的又一里程碑，在填補AI根技術(shù)在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測領(lǐng)域成績空白的同時，更加證明了其價值與優(yōu)越性。

未來，針對蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測問題，昇思MindSpore將攜手學(xué)術(shù)科研界更多合作伙伴，在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測領(lǐng)域共同探索、持續(xù)突破，助力國內(nèi)相關(guān)基礎(chǔ)研究，尤其是生命各分支學(xué)科的進步，推動創(chuàng)新制藥行業(yè)的發(fā)展。

蛋白質(zhì)折疊代碼倉路徑https://gitee.com/mindspore/mindscience/tree/master/MindSPONGE/mindsponge/fold。

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